Je deck bestaat voor 30% uit trainer kaarten. Fanatieke spelers weten waarom trainers zo belangrijk zijn, met deze kaarten kun je een wedstrijd volledig omdraaien. Heal je Pokemon er bijvoorbeeld mee, of zet er een in waarmee je een of meerdere Pokemon uit de stapel mag pakken. Met trainer en support kaarten kun je het momentum omdraaien en de bovenhand krijgen. Hierdoor kunnen je winkansen drastisch vergroten. In het Pokemon-ruilkaartspel zijn supporterkaarten gebaseerd op karakters uit de Pokemon-videogames. Ze gebruiken sterke vaardigheden waarmee je vaak kaarten van je aflegstapel kunt halen, kaarten van je aflegstapel kunt terugvinden of specifieke kaarten van je stapel kunt opzoeken. Om het spel in evenwicht te houden, kan elke speler slechts een supporter per beurt gebruiken. Verkrijgbaar per 10, 30 en 60 kaarten.
